Les variantes sud-africaine et brésilienne du virus Sars-CoV-2 ont une mutation qui rend plus difficile la neutralisation du virus par notre système immunitaire. Maintenant, des cas de la variante britannique plus contagieuse avec la même mutation émergent également. "C'est un atout pour le virus."
Cette variante sud-africaine du coronavirus possède neuf mutations dans la protéine épineuse avec laquelle le virus pénètre dans nos cellules. L'un d'eux, E484K, semble jouer un rôle crucial en déjouant nos défenses. Des tests en laboratoire ont déjà montré que les anticorps d'anciens patients atteints de Covid-19 ainsi que de vaccinés ont moins de prise sur le virus avec la mutation E484K, qui se produit également dans la variante brésilienne.
Onze cas sont maintenant connus au Royaume-Uni dans lesquels la variante britannique B.1.1.7 porte la mutation E484K. La variante britannique, qui selon les estimations les plus récentes est jusqu'à cinquante pour cent plus contagieuse, a maintenant une autre arme. Des scientifiques britanniques ont déjà signalé que davantage d'anticorps sont nécessaires pour neutraliser la "nouvelle" variante britannique, après avoir fourni une variante artificielle B.1.1.7 de la mutation E484K en laboratoire.
Nous avons généré des "pseudo" virus portant la protéine Spike du SARS-CoV-2 qui avaient les 8 mutations B.1.1.7 + E484K. Nous avons mélangé le virus avec des sérums d'individus vaccinés (Pfizer) Dans l'ensemble, E484K augmente considérablement la quantité d'anticorps sériques nécessaires pour prévenir l'infection des cellules. pic.twitter.com/K2hcjYzDnv
– Laboratoire Gupta, Cambridge (@GuptaR_lab) 2 février 2021
Jusqu'à présent, aucun cas de B.1.1.7 avec la mutation E484K n'a été signalé dans notre pays. "Mais cela semble n'être qu'une question de temps avant que cela n'arrive", déclare le spécialiste des maladies infectieuses Steven Callens (UZGent).
L'immunologue Geert Leroux-Roels (UZGent) suppose également que le mutant apparaîtra tôt ou tard. "Par importation, ou parce que la mutation se produit aussi spontanément ici", explique Leroux-Roels. Un rapport du gouvernement britannique indique que la mutation E484K serait apparue plusieurs fois. "Le résultat d'un processus complètement aléatoire", explique Leroux-Roels. "Mais les mutations comme E484K qui donnent un avantage au virus sont privilégiées et gagneront en "popularité" petit à petit."
À quel point est-ce problématique ? "C'est un atout pour le virus", explique Leroux-Roels. « La mutation se situe dans la partie de la protéine de la colonne vertébrale qui est la plus critique pour pénétrer dans nos cellules. Cela peut conduire à ce que la variante britannique, qui était auparavant assez bien reconnue par nos anticorps, soit maintenant également moins bien reconnue.'
Les récents résultats des études cliniques avec les vaccins de Johnson &Johnson et Novavax sont un signe sur le mur. Le vaccin Johnson &Johnson s'est avéré efficace à 66% en moyenne, mais la protection varie selon les régions. Aux États-Unis, l'efficacité était de 72 %, en Afrique du Sud et en Amérique latine de 57 et 66 %, respectivement. Novavax a obtenu près de 90 % au Royaume-Uni et 60 % dans une petite étude en Afrique du Sud. "Cela indique que la variante sud-africaine est moins bien reconnue que la variante originale de Wuhan ou la variante britannique", explique Leroux-Roels.
Cela ne signifie pas que les vaccins actuels n'offrent plus de protection. Mais ce n'est pas une évolution positive, c'est le moins qu'on puisse dire. "Les vaccins n'ont pas à être adaptés immédiatement", explique Callens. "Bien que cela sera probablement nécessaire à long terme."
Selon Callens, les événements récents ont des implications pour notre campagne de vaccination. « Pendant longtemps, on a parlé d'un taux de vaccination de 70 % qui serait nécessaire pour obtenir l'immunité collective. Mais ce chiffre dépend de la contagiosité du virus et de l'efficacité des vaccins. Un virus plus contagieux, associé à des vaccins qui peuvent moins bien protéger contre certaines variantes, signifie que le pourcentage de vaccinés requis pour l'immunité collective augmente. Il est donc d'autant plus important de vacciner le plus de personnes possible le plus rapidement possible. »