'eDNA' révèle quels animaux vivent dans les rivières.
L'ADN dans l'eau peut aider à cartographier la biodiversité des rivières, rapportent des chercheurs suisses dans Nature Communications.
Les animaux laissent constamment de l'ADN dans leur milieu de vie, y compris via les excréments et les squames. Cet 'eDNA' (ADN environnemental ) peut être utilisé par les scientifiques pour traquer les animaux. L'ADN de chaque organisme est unique à plusieurs endroits, et les scientifiques peuvent utiliser ces morceaux d'ADN spécifiques comme code-barres génétique pour distinguer les espèces les unes des autres.
Les chercheurs ont prélevé de l'eau dans une rivière et analysé l'eDNA. L'image de la biodiversité ainsi obtenue correspondait à ce que l'on sait de la vie dans et autour du fleuve. Ils ont identifié plus de 250 espèces, des éphémères aux castors.
Qualité de l'eau
L'Institut de Recherche Nature et Forêt (RIOB) travaille également sur des méthodes d'utilisation de l'eDNA pour analyser la biodiversité de nos rivières, lacs et mares. «Afin d'estimer la qualité de l'eau, nous examinons la composition de la communauté de poissons qui vit dans nos rivières», déclare Rein Brys (RIOB). « Nous le faisons actuellement en pêchant du poisson dans un grand nombre d'endroits. Mais cette méthode demande beaucoup de travail et n'est pas infaillible. eDNA peut aider à cartographier nos eaux plus efficacement et plus précisément à long terme.'
Les chercheurs du RIOB ont déjà pu démontrer que, sur la base d'une analyse de l'eDNA dans des échantillons d'eau, ils peuvent non seulement déterminer quelles espèces de poissons nagent dans l'eau, mais aussi en quel nombre une espèce particulière est présente. « Traduire la quantité d'ADN en biomasse ou en nombre d'animaux est la principale difficulté », explique Brys. Pour ce faire, les chercheurs étudient la quantité d'eDNA dans des bassins avec un nombre variable d'animaux.
Brys et ses collègues développent également des méthodes pour utiliser l'eDNA pour détecter des espèces exotiques telles que la grenouille taureau et des espèces rares telles que le triton crêté. Cartographier l'état de ces espèces rares en essayant de les capturer prend non seulement beaucoup de temps, mais perturbe également les populations. Là aussi, l'eDNA est une alternative prometteuse." (ddc)
