Un nouveau système d'apprentissage automatique devrait aider à étouffer les futures épidémies dans l'œuf.
Par quelles espèces de mammifères un nouveau virus peut-il infecter l'homme ? Des chercheurs de l'Université de Liverpool ont développé un nouveau système d'apprentissage automatique pour prédire cela. Le système a découvert plus de 20 000 nouveaux liens entre des virus connus et des mammifères potentiellement porteurs.
Selon des estimations récentes, les mammifères se transmettent des milliers de types de virus et seulement 1 % de la diversité virale de ces animaux est connue. Selon le type de virus, les maladies infectieuses ont un nombre limité ou un grand nombre de porteurs possibles. Les virus de l'immunodéficience tels que le VIH et le FIV, les virus responsables respectivement du SIDA et du SIDA félin, peuvent infecter peu d'espèces. Différents sont le virus de la rage, qui cause la rage, et le coronavirus SARS-CoV-2. Ils peuvent se propager dans de nombreuses espèces animales différentes. Ils sont également zoonotiques et peuvent donc faire le saut de l'animal à l'homme.
L'étude montre que le nombre de liens entre les virus connus qui passent des animaux aux humains et aux mammifères sauvages est cinq fois plus élevé que prévu. Les chauves-souris et les rongeurs en particulier présentent davantage de liens avec des virus transmissibles à l'homme. De plus, le système prédit une multiplication par cinq du nombre de liens entre les mammifères sauvages et les virus chez le bétail et les animaux de compagnie. Un manque de connaissances sur certaines espèces de mammifères augmente le risque qu'elles ne soient pas détectées en tant que porteurs potentiels de virus.
Image :Réseaux d'interactions observées et prédites entre des mammifères hôtes sauvages et semi-domestiques et des virus connus. Crédit :Maya Wardeh
Les chercheurs étudient actuellement s'ils peuvent étendre le modèle informatique pour prédire la transmission du virus chez les tiques et les insectes. Les scientifiques peuvent alors intervenir plus spécifiquement en cas d'apparition de virus par contact entre invertébrés, oiseaux et mammifères.
Source :Université de Liverpool, Royaume-Uni
