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Votre microbiome comme usine à médicaments

Les bactéries qui vivent sur et dans notre corps produiront-elles bientôt des médicaments pour des maladies telles que le diabète, le cancer du côlon, les rhumatismes et la sclérose en plaques ?

Chaque centimètre carré de votre corps abrite des bactéries. Les scientifiques parlent du microbiome humain :l'homme comme un écosystème ambulant. Tout au long de l'évolution, notre corps a toujours favorisé les relations intimes les plus intéressantes avec les bactéries. Ils forment donc aujourd'hui un prolongement indispensable de notre système digestif et immunitaire. Les micro-organismes influencent l'absorption des nutriments et des médicaments, ils produisent leurs propres vitamines, entraînent et renforcent notre système immunitaire et communiquent avec les nombreuses cellules nerveuses et hormonales de nos intestins.

La composition du microbiome a un impact majeur sur notre santé. Par exemple, les personnes ayant un écosystème bactérien faible dans leur corps - peu de bactéries et une faible diversité d'espèces - sont plus susceptibles de souffrir d'inflammations (intestinales), d'allergies et d'obésité. De nombreux scientifiques sont donc convaincus que le microbiome peut servir de moyen de diagnostic, mais aussi de thérapie :après tout, diverses études indiquent que de nombreux troubles peuvent être traités en introduisant une culture bactérienne souhaitée chez le patient.

En 2010, le chercheur Jeff Gordon de l'Université de Washington à Saint Louis (USA) a introduit des bactéries intestinales d'une souris obèse et d'une souris normale dans des souris stériles. Les souris avec les bactéries intestinales « obèses » sont devenues obèses et les autres non. À l'inverse, les souris obèses ont retrouvé un poids corporel sain après avoir été implantées dans le microbiome d'une souris normale. Les greffes dites fécales, dans lesquelles la flore intestinale d'origine est remplacée par celle d'un donneur sain, donnent également des résultats de recherche prometteurs. Pour le traitement des infections intestinales chroniques telles que la maladie de Crohn et la colite, une greffe fécale est bien plus efficace que, par exemple, les antibiotiques :alors que les antibiotiques n'apportent une solution que dans un quart des cas seulement, une flore intestinale saine expulse l'infection à Clostridium difficile dans 90% des cas, ce qui peut être à la base d'infections intestinales.

Investissements

À l'exception de la greffe de caca, la plupart des traitements potentiels du microbiome sont encore en phase de recherche. Mais les grandes sociétés pharmaceutiques s'intéressent de plus en plus à l'évaluation du potentiel de médicaments ou de traitements à base de nos propres bactéries. Au début de ce mois, le géant pharmaceutique Pfizer a annoncé qu'il s'associerait à la société de biotechnologie américaine Second Genome pour étudier les microbiomes de 900 personnes, y compris celles atteintes de maladies métaboliques. Le même Second Genome travaille également déjà avec Janssen Pharmaceutica de Beerse pour étudier le microbiome de patients atteints d'une maladie inflammatoire du côlon, dans l'espoir d'entrer en collision avec des médicaments potentiels.

Le français Enterome a récemment annoncé qu'il investissait dix millions d'euros dans le développement d'un test qui prédit votre risque de cancer du côlon, de diabète de type 2 ou de maladie du foie en fonction de la composition des bactéries intestinales. Et la société américaine Miomics prévoit de commercialiser un traitement qui utilise la bactérie Prevotella histicola pour supprimer l'inflammation causée par la sclérose en plaques ou la polyarthrite rhumatoïde.

ActoGeniX de Gand est allé encore plus loin en modifiant génétiquement une bactérie présente dans notre corps afin qu'elle produise une protéine (interleukine 10) qui calme le système immunitaire. La protéine est le chaînon manquant dans des maladies telles que la colite ulcéreuse et la maladie de Crohn. Le système immunitaire reste activé sans raison. Interleukin10 bloque cette activation. La bactérie génétiquement modifiée a été testée sur des modèles animaux, mais une première étude clinique à l'Academic Medical Center (AMC) d'Amsterdam a également donné des résultats positifs.

Redémarrer

Des investissements comme celui-ci suggèrent que le monde pharmaceutique croit au potentiel de notre microbiome en tant qu'outil de diagnostic ou même en tant qu'usine de médecine personnelle, et que les thérapies du microbiome pourraient bien être monnaie courante dans quelques années. "A l'avenir, les médecins poseront d'abord des questions sur le microbiome de leurs patients afin de construire leur diagnostic et de déterminer ce qu'ils prescrivent", explique le bioinformaticien Jeroen Raes (VUB et VIB), qui contribue au décryptage génétique de l'intestin. microbiome a reçu la percée de l'année par la revue Science en 2011. « Des études sont même en cours pour créer des bases de données avec des cultures bactériennes personnelles en bonne santé. Si votre flore intestinale est perturbée et que vous tombez malade en conséquence, la flore originale et saine peut être administrée à nouveau. Donc une sorte de redémarrage.'


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