La propagation du virus HSV-1 suit de près les premières migrations humaines hors d'Afrique.
Des chercheurs de l'Université du Wisconsin-Madison ont établi un arbre généalogique génétique du virus HSV-1. Sa propagation correspond étroitement aux premières migrations des populations humaines d'Afrique vers le reste du monde.
Ces scientifiques ont analysé 31 échantillons de HSV-1, un herpès courant hautement contagieux et excellent marqueur des contacts humains. Prélevés dans le monde entier, les génomes viraux ont été séquencés en détail. Grâce aux mutations sur 26 régions génomiques, ils ont reconstruit l'arbre phylogénétique complet du virus, identifiant précisément l'origine et le timing des mutations. Cet arbre s'aligne remarquablement sur les modèles de dispersion humaine hors d'Afrique.
Selon l'anthropologie, les humains ont quitté l'Afrique il y a 150 000 à 200 000 ans, migrant vers le Moyen-Orient, puis l'Asie et l'Europe. Le virus HSV-1 reproduit fidèlement ce parcours, avec des clades distincts en Afrique, Asie et Europe/Amériques, reflétant la divergence des populations.
Une découverte inattendue : au Texas, une variante liée au clade asiatique, arrivée en Amérique il y a environ 15 000 ans. Cela corrobore l'hypothèse de la migration des ancêtres des Amérindiens via le détroit de Béring. L'étude est publiée dans PLoS One (2020).
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