Un criblage de dizaines de milliers de bactéries du sol a conduit à la découverte d'un antibiotique puissant et à large action qui est également armé contre la résistance bactérienne.
Un criblage de dizaines de milliers de bactéries du sol, dont certaines provenant de l'arrière-cour des chercheurs, a conduit à la découverte d'un antibiotique puissant à large action qui est également armé contre la résistance bactérienne.
La résistance croissante des bactéries aux antibiotiques est l'une des plus grandes menaces pour notre médecine. Nous risquons littéralement de manquer d'antibiotiques. Une récente étude britannique prédit qu'à partir de l'an 2050, dix millions de personnes dans le monde mourront chaque année d'infections causées par des bactéries résistantes. Le paludisme, la tuberculose et la bactérie E. coli sont les plus grandes menaces. Malgré le besoin urgent de nouveaux antibiotiques, peu de nouveaux médicaments apparaissent sur le marché. Après tout, leur développement nécessite une approche créative, est très coûteux et le résultat longtemps recherché peut finalement s'avérer inutilisable si les bactéries pathogènes développent une résistance. En d'autres termes, la quête antibiotique n'est pas très motivante.
Une étude menée par des microbiologistes de la Northeastern University de Boston, aux États-Unis, publiée cette semaine dans la revue Nature la publication semble donc très prometteuse. Les scientifiques étudient les bactéries du sol qui ne veulent pas se développer en laboratoire - environ 99% du total. De nombreux antibiotiques existants, dont la pénicilline, ont été découverts dans des organismes du sol cultivés en laboratoire. Les microbes se livrent régulièrement une « guerre chimique » les uns aux autres, et nous pouvons parfois utiliser ces armes pour combattre des agents infectieux.
Mais le stock de bactéries du sol qui veulent se développer dans le laboratoire est limité et progressivement épuisé. En 2002, des microbiologistes de la Northeastern University de Boston ont donc mis au point une technique pour cultiver des bactéries du sol dans leur milieu naturel. Pour ce faire, ils mettent des échantillons de sol dans une préparation avec une membrane perméable et l'enfouissent dans le sol. Les bactéries du sol peuvent se développer dans leur environnement naturel, mais elles restent disponibles pour la recherche en laboratoire.
Les Américains ont étudié des milliers d'échantillons de sol provenant de toutes sortes d'endroits, y compris leur propre arrière-cour. Ils ont laissé les bactéries "domestiquées" qui se sont développées dans les échantillons mener une guerre en laboratoire avec Staphylococcus aureus , cause d'infections cutanées et respiratoires graves. Cela a conduit à la découverte de quelque 10 000 armes chimiques, dont une substance qui s'est avérée mortelle pour toute une gamme d'agents pathogènes humains. De plus, ces pathogènes n'ont pas développé de résistance. Contrairement à d'autres antibiotiques, aucune bactérie individuelle n'a survécu à une attaque avec la substance - empêchant une souche résistante de se développer. La substance, appelée teixobactine, n'est pas nocive pour les cellules humaines.
Des scientifiques de l'Université de Bonn ont ensuite étudié pourquoi la teixobactine est résistante à la résistance. La substance endommage deux lipides importants qui sont nécessaires à la construction de la paroi cellulaire d'une bactérie. Ces blocs de construction sont assez courants chez les bactéries et leur fonctionnement est très insensible aux mutations. En d'autres termes, développer une résistance est un énorme défi pour les bactéries. Contre la vancomycine, une autre substance à effet similaire utilisée contre la bactérie hospitalière (MRSA),
les bactéries ont fini par développer une résistance, mais cela a pris trente ans. Selon les Allemands, la teixobactine est plusieurs fois plus puissante.
La découverte de la teixobactine est une petite percée dans la recherche de nouveaux antibiotiques, mais peut-être encore plus encourageante est le fait que cette étude prouve qu'il reste encore de nombreux antibiotiques à découvrir dans le sol. La bataille contre les pathogènes résistants est donc loin d'être perdue.
Dans le prochain numéro d'Eos , qui sera en magasin fin janvier, le journaliste scientifique Jop de Vrieze fera un tour d'horizon des différentes recherches scientifiques d'alternatives aux antibiotiques actuels.
